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Comptapolis
Comparatif 2026

Les meilleurs logiciels de comptabilité pour TPE et PME

Les TPE et PME ont besoin d'une comptabilité d'engagement complète avec gestion de la TVA, rapprochement bancaire, clôture annuelle et souvent paie. Ces logiciels répondent à ces exigences.

Les logiciels recommandés pour ce profil

Nous avons sélectionné les 8 logiciels les plus pertinents pour ce profil parmi notre comparatif complet.

LogicielÀ partir deGratuitPour quiOCRAvis 
Pennylane
Le logiciel de gestion financière pour TPE et PME
29 HT/mois
Essai 14 j
SASSARL
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Tiime
L'appli comptable des entrepreneurs au quotidien
Gratuit
Plan gratuit
Dirigeants TPESASU
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Dougs (logiciel)
La plateforme comptable de l'expert-comptable en ligne Dougs
49 HT/mois
Clients Dougs
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Henrri
Le logiciel de facturation gratuit pour TPE
Gratuit
Plan gratuit
TPEAuto-entrepreneurs
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Shine
Le compte pro avec comptabilité intégrée
7.9 HT/mois
Essai 30 j
Auto-entrepreneursFreelances
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Qonto
La néobanque pro avec facturation intégrée
9 HT/mois
Essai 30 j
TPESAS
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Sage 50
Le logiciel comptable historique pour PME
29 HT/mois
Essai 30 j
PMEArtisans
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QuickBooks
La référence mondiale de la comptabilité TPE/PME
12 HT/mois
Essai 30 j
TPESAS
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Critères de choix pour ce profil

Les TPE et PME ont des obligations comptables complètes (comptabilité d'engagement, bilan, liasse fiscale, TVA, potentiellement paie). Le logiciel doit soit gérer tout cela en autonomie, soit se connecter parfaitement à l'expert-comptable.

Critères prioritaires

  • Comptabilité d'engagement complète : écritures, lettrage, balance.
  • Déclarations TVA automatisées (mensuelles ou trimestrielles).
  • Export FEC pour transmission au cabinet comptable.
  • Multi-utilisateurs : équipes, assistants, cabinet.

Questions fréquentes

Pennylane ou Sage pour une PME ?
Pennylane est plus moderne, cloud-native et mieux adapté aux PME digitalisées. Sage reste pertinent pour les PME industrielles avec des besoins ERP.
Le logiciel remplace-t-il un expert-comptable ?
Pour les profils les plus simples, oui. Pour une société ou un LMNP au réel, le logiciel est un outil complémentaire — l'expert-comptable reste recommandé pour certifier les comptes et sécuriser les déclarations.
Peut-on migrer d'un logiciel à l'autre ?
Oui, à condition d'exporter ses données au format FEC (Fichier des Écritures Comptables). Tous les logiciels sérieux proposent cet export standard.

Pas sûr du logiciel adapté ?

Décrivez votre activité en 2 minutes. Nous vous recommandons le logiciel ou l'expert-comptable le plus adapté.